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C’est un fichier d’information chimique créé par ChemDraw, une suite de programme de montage de molécule pour les plates-formes Macintosh et Windows. Il stocke les données moléculaires dans un format binaire marqué. Il est utilisé pour conserver des dessins chimiques précis. Les fichiers CDX stockent des informations telles que les atomes, les liaisons, les fragments, les flèches et du texte.
Le format CDX est le format natif utilisé par ChemDraw. L’autre format est appelé CDXML (fichiers .CDXML) qui est utilisé pour l’exportation et l’échange de données CDX à un format XML.